El género "hentai" (pervertido) es aquel que contiene escenas de sexo explícito entre sus páginas. Las variantes también son amplias, ya que cualquier personaje de cualquier manga es susceptible de convertirse en un personaje erótico. Niñas y niños pequeñas ("lolicon"), chicas mágicas, amas de casa, robots con apariencia humana o demonios de la mitología japonesa que se personifican en humanos. El hentai cubre una gran parte de las ventas de mangas del país. La afición por los temas pornográficos lleva a muchos "mangakas" noveles a dibujar sus propias ilustraciones y editarlas en unos libros denominados "dojinshis" que intentan vender en las convenciones de japón.

Ecchi El ecchi es la pronunciación en inglés de la "H" de hentai. Esto quiere decir que sería una variante mas suave de la pornografía explícita, aunque muchos japoneses la utilizan como eufemismo. En las historias no se ven situaciones de sexo pero se sugieren amenizadas con situaciones cómicas que le restan importancia. El prototipo de comedia ecchi utiliza personajes masculinos que ante cualquier provocación de las chicas se excitan y expulsan sangre por la nariz como símbolo de la misma. Generalmente las chicas con uniformes ligeros de ropa y grandes pechos son combinados con otros más infantiles. Esa es la forma más clara de sugerir aunque siempre hay escenas de humor en las que se ve la ropa interior de las jóvenes o acercamientos que se asemejan a los sexuales. Los rasgos de los protagonistas son muy parecidos a los de las chicas shoujo pero enfatizando sus características sexuales.

Yaoi Es el subgénero en el que se tratan relaciones homosexuales. En sus páginas no tienen por qué aparecer situaciones comprometidas o pornográficas, ya que lo que importan son los sentimientos de los protagonistas, en este caso el yaoi pasa a denominarse shonen-ai (amor entre chicos). El yaoi propiamente dicho sí trata las relaciones sexuales. En la mayoría de los casos, los jóvenes que aparecen están muy estilizados, con largas piernas, ojos grandes y llamativos y personalidades propias de un caballero. Dentro e las parejas que se forman hay dos roles que se siguen al pie de la letra. Uno de los personajes es el conocido como "Seme", palabra proveniente del verbo japonés "semeru" que significa atacar. Éste es el factor activo de la relación, el que inicia las situaciones de tensión y el que declara abiertamente sus emociones. Por otro lado se encuentra el "Uke", que viene del verbo "ukeru", recibir, y que simboliza el personaje pasivo. Algunos de los chicos parecen mujeres por lo que en ocasiones confunden al lector. El yaoi y el shonen-ai son dos de los géneros que más adeptos tiene entre el sector femenino. Uno de los yaoi más conocido que ha llegado a España es Gravitation. Entre los más famosos también se encuentran Loveless y Gakuen Heaven.

Yuri El yuri es la variante del yaoi en el género femenino. Las relaciones entre chicas también tienen mangas donde se muestran sus sentimientos (shoujo-ai) y las escenas no pasan de acercamientos amorosos. En el yuri también se dan dos roles de atacante y seducido.

La mujer "tachi" es la que seduce ala otra parte del binomio a la que se la denomina "neko"(gato).

Algunos de los yuris más conocidos son Strawerry Panic!, María Sama ga Miteru o Kannazuki no Miko.